구기연은 서울대학교 아시아연구소 교수이자 법무부 난민위원회 자문위원으로 활동 중이다. 서아시아센터 연구책임자로서 서아시아 연구 이니셔티브를 주도하고 관련 학술 행사를 조직하고 있다. 한국 내 중동학 연구 강화를 위해 신진 학자와 학부생들을 위한 지원 프로그램을 개발하여 차세대 지역 전문가를 양성하고 있다. 대표 저서 <이란 도시 젊은이, 그들만의 세상 만들기>와 <아랍의 봄 그 후 10년의 흐름>은 교육부 우수학술도서로 선정된 바 있다. 이외에도 다수의 국내외 학술논문을 발표하였다. 연구자이자 공공 지식인으로서 구기연은 한국 내 서아시아와 중동 연구를 발전시키며 한국 학계와 국제 학술 네트워크 간의 연결을 촉진하고 있다.