이성훈은 경희대 공공대학원 특임교수로 인권과 개발 및 지속가능발전목표(SDGs)에 대해 강의하고 있으며 평창평화포럼(PGPF) 자문위원이자 운영위원으로 활동하고 있다. 동시에 외교부 정책자문위원, 한국국제협력단(KOICA) 인권전문위원, 국제개발협력민간협의회(KCOC) 정책홍보위원으로도 활동하고 있으며, 국제적으로는 세계시민단체인 CIVICUS 국제이사(2011-2016)로 활동했고, 2013년 아시아발전연대(Asia Development Alliance, ADA)와 아시아민주주의네트워크 (Asia Democracy Network, ADN) 설립에 주도적인 역할을 했고 현재는 자문 역할을 맡고 있다. 인권분야에서는 방콕에 본부가 있는 아시아 인권단체 연합체인 포럼아시아의 사무총장 (2005-2008), 한국 국가인권위원회 정책교육국장 (2018-2010), 한국인권재단 상임이사 (2010-2017)를 역임했다. 이전에는 홍콩 국제가톨릭대학생운동(IMCS) 아시아본부 사무국장 (1988-1991), 스위스 제네바 국제가톨릭지식인문화운동(ICMICA) 사무총장 (1997-2004)으로 가톨릭 사회운동 분야에서 일했다.